腐敗是高校健康發展的最大威脅，具有“免疫系統”功能的內部審計也要見實效，在高校腐敗治理中發揮重要作用。審計監督是一種經常性的監督，能持續、動態地發現潛在的腐敗問題線索。與高校內設的紀檢、監察等監督部門相比，審計發現違法違紀線索更具有主動性，揭露腐敗事實往往早于其它監督部門，可以讓存在腐敗動機的人心存畏懼而不敢腐，達到揭露一個、震懾一片的效果。

提升內部審計在高校治理中的地位和層次。目前，我國大部分高校都將內部審計定位為輔助管理部門，并與其它內設處室、學院平行設置，導致內部審計在當前高校治理結構中的獨立性、權威性大打折扣，無法實現對權力的有效監督。高校應通過提升內部審計的地位與層次，充分發揮其對資金運用和權力行使的監督、檢查和評價作用。建立問責機制，突破審計監督難、執行整改難等現實問題，提高審計效能，提升腐敗治理效果。

強化與紀檢監察部門的合作。高校內部監督機構除內部審計外，還包括紀檢、監察等部門，這些部門雖然監督對象和職責范圍不同，但在反腐倡廉工作中卻有很高的關聯度。高校內部腐敗治理工作不能單靠某一部門單打獨斗，需要紀檢、監察、審計等部門之間協同工作，密切配合。紀檢監察在對涉及經濟問題的舉報信訪案件進行查證時，可以借用審計人員利用專業優勢，為案件調查取證提供幫助。內部審計也可以利用紀檢監察的舉報信訪來確定審計重點，二者優勢互補，有利于增強整個監督體系的威懾力。

調整內部審計的工作方向，前移審計監督關口。目前，高校內部審計開展較多的業務如離任經濟責任審計、工程項目結算審計等都屬于事后審計，審計的“免疫系統”功能沒有充分發揮出來。在腐敗治理上，“防”要遠遠勝于“反”。高校內部審計應在不參與決策和管理、不損害審計獨立性的前提下，提高審計工作的主動性，提前介入，對問題早發現、早預防，才能充分發揮內部審計在腐敗治理中的作用。

提高人員素質，提升反腐效能。目前，我國高校內部審計人員的綜合素質、業務能力和知識結構與腐敗治理的需求還存在較大差距，還不能滿足反腐敗工作需要。因此，高校必須優化內審人員的專業配置，開展針對高校腐敗特點和腐敗治理能力的培訓，提高審計人員查處和揭露腐敗問題的能力。